Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMC1P11047 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMC1P11047 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms