Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL3P10147 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL3P10147 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL3P10147 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL3P10147 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL3P10147 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCL3P10147 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL3P10147 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL3P10147 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL3P10147 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL3P10147 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL3P10147 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL3P10147 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL3P10147 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL3P10147 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL3P10147 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL3P10147 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL3P10147 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL3P10147 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL3P10147 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL3P10147 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL3P10147 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL3P10147 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL3P10147 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL3P10147 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL3P10147 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCL3P10147 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL3P10147 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL3P10147 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL3P10147 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL3P10147 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL3P10147 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL3P10147 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CCL3P10147 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3P10147 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3P10147 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3P10147 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3P10147 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3P10147 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3P10147 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3P10147 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3P10147 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3P10147 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3P10147 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3P10147 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3P10147 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3P10147 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3P10147 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3P10147 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3P10147 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3P10147 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3P10147 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3P10147 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3P10147 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3P10147 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3P10147 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3P10147 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3P10147 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3P10147 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3P10147 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3P10147 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3P10147 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3P10147 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3P10147 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3P10147 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3P10147 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3P10147 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3P10147 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3P10147 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3P10147 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3P10147 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3P10147 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3P10147 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3P10147 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3P10147 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3P10147 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3P10147 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCL3P10147 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3P10147 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3P10147 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3P10147 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3P10147 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3P10147 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3P10147 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3P10147 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3P10147 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3P10147 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3P10147 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3P10147 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3P10147 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3P10147 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3P10147 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3P10147 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3P10147 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3P10147 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3P10147 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3P10147 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3P10147 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3P10147 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL3P10147 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms