Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RGPD2P0DJD1 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms