Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NGFRP08138 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NGFRP08138 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NGFRP08138 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NGFRP08138 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NGFRP08138 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NGFRP08138 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NGFRP08138 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NGFRP08138 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NGFRP08138 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NGFRP08138 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NGFRP08138 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NGFRP08138 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NGFRP08138 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NGFRP08138 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NGFRP08138 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NGFRP08138 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NGFRP08138 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NGFRP08138 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NGFRP08138 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NGFRP08138 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NGFRP08138 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NGFRP08138 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NGFRP08138 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NGFRP08138 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NGFRP08138 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NGFRP08138 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NGFRP08138 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NGFRP08138 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NGFRP08138 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NGFRP08138 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NGFRP08138 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NGFRP08138 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NGFRP08138 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NGFRP08138 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NGFRP08138 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NGFRP08138 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NGFRP08138 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NGFRP08138 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NGFRP08138 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NGFRP08138 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NGFRP08138 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NGFRP08138 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NGFRP08138 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NGFRP08138 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NGFRP08138 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NGFRP08138 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NGFRP08138 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NGFRP08138 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NGFRP08138 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NGFRP08138 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NGFRP08138 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NGFRP08138 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NGFRP08138 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NGFRP08138 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NGFRP08138 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NGFRP08138 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NGFRP08138 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NGFRP08138 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NGFRP08138 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NGFRP08138 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NGFRP08138 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NGFRP08138 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NGFRP08138 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NGFRP08138 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NGFRP08138 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NGFRP08138 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NGFRP08138 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NGFRP08138 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NGFRP08138 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NGFRP08138 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NGFRP08138 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NGFRP08138 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NGFRP08138 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NGFRP08138 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NGFRP08138 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NGFRP08138 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NGFRP08138 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NGFRP08138 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NGFRP08138 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NGFRP08138 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NGFRP08138 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NGFRP08138 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NGFRP08138 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NGFRP08138 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NGFRP08138 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NGFRP08138 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NGFRP08138 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NGFRP08138 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NGFRP08138 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NGFRP08138 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NGFRP08138 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NGFRP08138 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NGFRP08138 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NGFRP08138 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NGFRP08138 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NGFRP08138 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NGFRP08138 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NGFRP08138 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NGFRP08138 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms