Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERPIND1P05546 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms