Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRB1P04280 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRB1P04280 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRB1P04280 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRB1P04280 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRB1P04280 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PRB1P04280 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRB1P04280 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRB1P04280 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PRB1P04280 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRB1P04280 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRB1P04280 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRB1P04280 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRB1P04280 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRB1P04280 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRB1P04280 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRB1P04280 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRB1P04280 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRB1P04280 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRB1P04280 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRB1P04280 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRB1P04280 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRB1P04280 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRB1P04280 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRB1P04280 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRB1P04280 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRB1P04280 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRB1P04280 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRB1P04280 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRB1P04280 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRB1P04280 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRB1P04280 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRB1P04280 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRB1P04280 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRB1P04280 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB1P04280 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB1P04280 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB1P04280 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB1P04280 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB1P04280 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB1P04280 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB1P04280 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB1P04280 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB1P04280 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB1P04280 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB1P04280 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB1P04280 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB1P04280 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB1P04280 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB1P04280 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB1P04280 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB1P04280 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB1P04280 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB1P04280 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB1P04280 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB1P04280 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB1P04280 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB1P04280 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB1P04280 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB1P04280 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB1P04280 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB1P04280 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB1P04280 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB1P04280 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB1P04280 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB1P04280 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB1P04280 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB1P04280 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB1P04280 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRB1P04280 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRB1P04280 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRB1P04280 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRB1P04280 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRB1P04280 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRB1P04280 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRB1P04280 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRB1P04280 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRB1P04280 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRB1P04280 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRB1P04280 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRB1P04280 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRB1P04280 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRB1P04280 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRB1P04280 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRB1P04280 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRB1P04280 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRB1P04280 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRB1P04280 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRB1P04280 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRB1P04280 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRB1P04280 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRB1P04280 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRB1P04280 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRB1P04280 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRB1P04280 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRB1P04280 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRB1P04280 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PRB1P04280 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRB1P04280 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRB1P04280 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms