Protein–RNA interactions for Protein: P01857

IGHG1, Immunoglobulin heavy constant gamma 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHG1P01857 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms