Protein–RNA interactions for Protein: O95819

MAP4K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP4K4O95819 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MAP4K4O95819 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MAP4K4O95819 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MAP4K4O95819 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MAP4K4O95819 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MAP4K4O95819 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MAP4K4O95819 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MAP4K4O95819 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MAP4K4O95819 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MAP4K4O95819 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MAP4K4O95819 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MAP4K4O95819 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MAP4K4O95819 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MAP4K4O95819 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MAP4K4O95819 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MAP4K4O95819 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
MAP4K4O95819 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MAP4K4O95819 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MAP4K4O95819 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MAP4K4O95819 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MAP4K4O95819 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MAP4K4O95819 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MAP4K4O95819 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MAP4K4O95819 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MAP4K4O95819 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
MAP4K4O95819 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MAP4K4O95819 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MAP4K4O95819 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MAP4K4O95819 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MAP4K4O95819 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MAP4K4O95819 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MAP4K4O95819 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MAP4K4O95819 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MAP4K4O95819 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MAP4K4O95819 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MAP4K4O95819 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MAP4K4O95819 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MAP4K4O95819 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MAP4K4O95819 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MAP4K4O95819 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MAP4K4O95819 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAP4K4O95819 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAP4K4O95819 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAP4K4O95819 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAP4K4O95819 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAP4K4O95819 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAP4K4O95819 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MAP4K4O95819 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAP4K4O95819 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAP4K4O95819 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAP4K4O95819 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAP4K4O95819 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAP4K4O95819 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
MAP4K4O95819 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MAP4K4O95819 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
MAP4K4O95819 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MAP4K4O95819 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MAP4K4O95819 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MAP4K4O95819 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAP4K4O95819 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAP4K4O95819 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAP4K4O95819 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
MAP4K4O95819 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MAP4K4O95819 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAP4K4O95819 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAP4K4O95819 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAP4K4O95819 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MAP4K4O95819 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAP4K4O95819 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAP4K4O95819 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MAP4K4O95819 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MAP4K4O95819 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAP4K4O95819 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAP4K4O95819 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAP4K4O95819 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MAP4K4O95819 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAP4K4O95819 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAP4K4O95819 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MAP4K4O95819 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MAP4K4O95819 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAP4K4O95819 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAP4K4O95819 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MAP4K4O95819 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MAP4K4O95819 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
MAP4K4O95819 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MAP4K4O95819 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAP4K4O95819 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MAP4K4O95819 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
MAP4K4O95819 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MAP4K4O95819 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MAP4K4O95819 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAP4K4O95819 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAP4K4O95819 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAP4K4O95819 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAP4K4O95819 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAP4K4O95819 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAP4K4O95819 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAP4K4O95819 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MAP4K4O95819 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MAP4K4O95819 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms