Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABARAPO95166 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms