Protein–RNA interactions for Protein: O94983

CAMTA2, Calmodulin-binding transcription activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA2O94983 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAMTA2O94983 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms