Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms