Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCN2BO60939 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SCN2BO60939 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms