Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLXNC1O60486 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLXNC1O60486 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLXNC1O60486 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLXNC1O60486 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLXNC1O60486 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLXNC1O60486 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLXNC1O60486 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLXNC1O60486 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLXNC1O60486 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLXNC1O60486 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLXNC1O60486 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLXNC1O60486 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PLXNC1O60486 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLXNC1O60486 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLXNC1O60486 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PLXNC1O60486 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PLXNC1O60486 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PLXNC1O60486 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PLXNC1O60486 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLXNC1O60486 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms