Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNMO15061 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNMO15061 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNMO15061 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNMO15061 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNMO15061 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNMO15061 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNMO15061 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNMO15061 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNMO15061 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNMO15061 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNMO15061 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNMO15061 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNMO15061 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNMO15061 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNMO15061 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNMO15061 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNMO15061 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNMO15061 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNMO15061 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNMO15061 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNMO15061 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNMO15061 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNMO15061 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNMO15061 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNMO15061 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNMO15061 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNMO15061 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNMO15061 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNMO15061 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNMO15061 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNMO15061 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNMO15061 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNMO15061 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNMO15061 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNMO15061 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNMO15061 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNMO15061 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNMO15061 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNMO15061 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNMO15061 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNMO15061 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNMO15061 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNMO15061 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNMO15061 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNMO15061 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNMO15061 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNMO15061 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNMO15061 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNMO15061 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNMO15061 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNMO15061 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNMO15061 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNMO15061 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNMO15061 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNMO15061 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNMO15061 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNMO15061 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNMO15061 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNMO15061 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNMO15061 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNMO15061 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNMO15061 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNMO15061 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNMO15061 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNMO15061 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNMO15061 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNMO15061 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNMO15061 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNMO15061 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNMO15061 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNMO15061 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNMO15061 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNMO15061 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNMO15061 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNMO15061 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNMO15061 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNMO15061 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNMO15061 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNMO15061 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNMO15061 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNMO15061 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNMO15061 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNMO15061 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNMO15061 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNMO15061 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNMO15061 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNMO15061 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNMO15061 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNMO15061 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNMO15061 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNMO15061 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNMO15061 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNMO15061 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNMO15061 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNMO15061 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNMO15061 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNMO15061 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNMO15061 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNMO15061 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms