Protein–RNA interactions for Protein: O00472

ELL2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL2O00472 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ELL2O00472 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ELL2O00472 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ELL2O00472 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ELL2O00472 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ELL2O00472 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ELL2O00472 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ELL2O00472 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ELL2O00472 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ELL2O00472 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ELL2O00472 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ELL2O00472 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ELL2O00472 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ELL2O00472 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ELL2O00472 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELL2O00472 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELL2O00472 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELL2O00472 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELL2O00472 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELL2O00472 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELL2O00472 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELL2O00472 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELL2O00472 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELL2O00472 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELL2O00472 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELL2O00472 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELL2O00472 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELL2O00472 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ELL2O00472 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ELL2O00472 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ELL2O00472 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ELL2O00472 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELL2O00472 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELL2O00472 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELL2O00472 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ELL2O00472 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELL2O00472 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELL2O00472 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ELL2O00472 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELL2O00472 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELL2O00472 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELL2O00472 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELL2O00472 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ELL2O00472 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ELL2O00472 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELL2O00472 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELL2O00472 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELL2O00472 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELL2O00472 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELL2O00472 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELL2O00472 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELL2O00472 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELL2O00472 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELL2O00472 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELL2O00472 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ELL2O00472 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELL2O00472 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELL2O00472 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELL2O00472 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELL2O00472 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELL2O00472 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELL2O00472 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELL2O00472 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ELL2O00472 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELL2O00472 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELL2O00472 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELL2O00472 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELL2O00472 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELL2O00472 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELL2O00472 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELL2O00472 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELL2O00472 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELL2O00472 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELL2O00472 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELL2O00472 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELL2O00472 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELL2O00472 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELL2O00472 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELL2O00472 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELL2O00472 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELL2O00472 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELL2O00472 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELL2O00472 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELL2O00472 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELL2O00472 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELL2O00472 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELL2O00472 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELL2O00472 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELL2O00472 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELL2O00472 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ELL2O00472 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ELL2O00472 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ELL2O00472 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ELL2O00472 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ELL2O00472 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ELL2O00472 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ELL2O00472 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ELL2O00472 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ELL2O00472 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ELL2O00472 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms