Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD8-MDP1E9PL57 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NEDD8-MDP1E9PL57 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.5 ms