Protein–RNA interactions for Protein: E5RI56

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E5RI56 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E5RI56 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E5RI56 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E5RI56 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E5RI56 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
E5RI56 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E5RI56 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E5RI56 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E5RI56 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E5RI56 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E5RI56 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E5RI56 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E5RI56 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E5RI56 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E5RI56 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E5RI56 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E5RI56 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E5RI56 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E5RI56 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E5RI56 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E5RI56 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E5RI56 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E5RI56 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E5RI56 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E5RI56 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E5RI56 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E5RI56 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E5RI56 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E5RI56 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E5RI56 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E5RI56 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E5RI56 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E5RI56 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E5RI56 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
E5RI56 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E5RI56 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E5RI56 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E5RI56 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E5RI56 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E5RI56 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E5RI56 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E5RI56 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E5RI56 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E5RI56 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E5RI56 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E5RI56 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E5RI56 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E5RI56 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E5RI56 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E5RI56 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E5RI56 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
E5RI56 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
E5RI56 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E5RI56 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E5RI56 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E5RI56 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E5RI56 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
E5RI56 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
E5RI56 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E5RI56 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E5RI56 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E5RI56 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
E5RI56 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
E5RI56 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
E5RI56 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
E5RI56 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
E5RI56 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
E5RI56 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
E5RI56 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
E5RI56 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
E5RI56 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E5RI56 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
E5RI56 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E5RI56 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E5RI56 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E5RI56 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E5RI56 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E5RI56 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E5RI56 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E5RI56 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E5RI56 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
E5RI56 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E5RI56 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E5RI56 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E5RI56 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E5RI56 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E5RI56 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E5RI56 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E5RI56 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E5RI56 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E5RI56 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E5RI56 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E5RI56 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E5RI56 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E5RI56 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E5RI56 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E5RI56 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E5RI56 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E5RI56 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E5RI56 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms