Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms