Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms