Protein–RNA interactions for Protein: B1AKI9

ISM1, Isthmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISM1B1AKI9 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ISM1B1AKI9 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms