Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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