Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms