Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC162PA2VCL2 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms