Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX8Q9Y5X2 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms