Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ9

TNRC6B, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6BQ9UPQ9 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNRC6BQ9UPQ9 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TNRC6BQ9UPQ9 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNRC6BQ9UPQ9 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms