Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV3

CIZ1, Cip1-interacting zinc finger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1Q9ULV3 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CIZ1Q9ULV3 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CIZ1Q9ULV3 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CIZ1Q9ULV3 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CIZ1Q9ULV3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CIZ1Q9ULV3 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms