Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FZD4Q9ULV1 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms