Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
BRPF3Q9ULD4 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms