Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK99

FBXO3, F-box only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO3Q9UK99 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO3Q9UK99 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FBXO3Q9UK99 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FBXO3Q9UK99 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FBXO3Q9UK99 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FBXO3Q9UK99 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FBXO3Q9UK99 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO3Q9UK99 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO3Q9UK99 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO3Q9UK99 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO3Q9UK99 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO3Q9UK99 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO3Q9UK99 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO3Q9UK99 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms