Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms