Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SFMBT1Q9UHJ3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms