Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms