Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms