Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC23■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC23■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC23■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms