Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2Q2

FRMD4A, FERM domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,039 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD4AQ9P2Q2 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FRMD4AQ9P2Q2 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms