Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MBD5Q9P267 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MBD5Q9P267 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MBD5Q9P267 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MBD5Q9P267 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MBD5Q9P267 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MBD5Q9P267 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MBD5Q9P267 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
MBD5Q9P267 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
MBD5Q9P267 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MBD5Q9P267 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MBD5Q9P267 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MBD5Q9P267 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MBD5Q9P267 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MBD5Q9P267 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
MBD5Q9P267 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MBD5Q9P267 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MBD5Q9P267 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MBD5Q9P267 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MBD5Q9P267 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MBD5Q9P267 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MBD5Q9P267 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MBD5Q9P267 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MBD5Q9P267 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MBD5Q9P267 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MBD5Q9P267 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MBD5Q9P267 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MBD5Q9P267 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MBD5Q9P267 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms