Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms