Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA2D2Q9NY47 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA2D2Q9NY47 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA2D2Q9NY47 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA2D2Q9NY47 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CACNA2D2Q9NY47 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CACNA2D2Q9NY47 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CACNA2D2Q9NY47 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CACNA2D2Q9NY47 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA2D2Q9NY47 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.3 ms