Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GDAP2Q9NXN4 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GDAP2Q9NXN4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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