Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT57Q9NWB7 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms