Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMILIN3Q9NT22 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMILIN3Q9NT22 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMILIN3Q9NT22 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMILIN3Q9NT22 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
EMILIN3Q9NT22 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
EMILIN3Q9NT22 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
EMILIN3Q9NT22 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
EMILIN3Q9NT22 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
EMILIN3Q9NT22 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMILIN3Q9NT22 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms