Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNX15Q9NRS6 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms