Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms