Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A4GALTQ9NPC4 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms