Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSU72Q9NP77 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms