Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HMG20AQ9NP66 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms