Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVK-5Q9HDB9 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms