Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRHQ9HD43 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRHQ9HD43 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms