Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD15

SRA1, Steroid receptor RNA activator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRA1Q9HD15 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRA1Q9HD15 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms