Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0U4

RAB1B, Ras-related protein Rab-1B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1BQ9H0U4 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB1BQ9H0U4 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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